Na área de Saneamento, a SHS elabora projetos de Estações de Tratamento de Águas Residuárias – esgotos sanitários e industriais, oferece consultoria para a operação e monitoramento de sistemas de tratamento de águas residuárias, elabora estudos de alternativas tecnológicas para a implementação de sistemas de tratamento de efluentes, estudos de autodepuração de cursos d’água e desenvolve Planos de Saneamento Básico para bacias hidrográficas ou para municípios.